FSM - i2b2 Cardiologia Molecolare

Additional Info

  • Stato: Concluso
  • Centro coordinatore: IRCCS Fondazione Salvatore Maugeri, Pavia (IT)
  • Ambito: Cardiologia
  • Data Inizio: Sabato, 01 Gennaio 2011
  • Soluzioni: i2b2
  • Descrizione:


    Il progetto CARDIO-i2b2 ha l'obiettivo di personalizzare la piattaforma bioinformatca i2b2 per integrare dati clinici e di ricerca al fine di supportare la ricerca traslazionale in cardiologia in FSM (Fondazione Salvatore Maugeri). CARDIO-i2b2 raccoglie i dati provenienti dai database del Laboratorio di Cardiologia Molecolare e li unisce ai dati clinici del sistema TRIAD, un sistema informativo per raccogliere i dati relativi a patologie aritmogeniche. Sono raccolte anche le informazioni genetiche relative ai pazienti affetti.

    I dati contenuti nel database relazionale TRIAD sono stati esportati nel data warehouse i2b2. Un'apposita estensione di i2b2 è stata sviluppata per includere il software statico R all'interno dell'architettura e sfruttare le funzionalità statistiche di R tramite l'interfaccia web i2b2. Per consentire ai ricercatori di eseguire dinamicamente l'analisi di sopravvivenza di Kaplan-Meier su pazienti selezionati è stato sviluppato un plugin apposito (Figura 1).

    fsm-cardiology

    Figura 1: Plugin per analisi di sopravvivenza
  • Riferimenti:


    Segagni D, Tibollo V, Dagliati A, Napolitano C, G Priori S, Bellazzi R. (2012) CARDIO-i2b2: integrating arrhythmogenic disease data in i2b2. Stud Health Technol Inform.180:1126-8. (link, pdf)

    Segagni D, Tibollo V, Dagliati A, Malovini A, Zambelli A, Napolitano C, Priori SG, Bellazzi R. Clinical and research data integration: the i2b2-FSM experience. AMIA Jt Summits Transl Sci Proc. 2013 Mar 18;2013:239-40. eCollection 2013. (pdf)

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